Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd1Q61345 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms