Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cnot7Q60809 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms