Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3aQ60520 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms