Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Tsr1Q5SWD9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms