Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms