Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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