Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trappc3lQ4KL14 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc3lQ4KL14 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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