Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms