Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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