Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms