Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx27Q3UHD6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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