Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf180Q3U827 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf180Q3U827 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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