Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U6N9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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