Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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