Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms