Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ulk3Q3U3Q1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ulk3Q3U3Q1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ulk3Q3U3Q1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ulk3Q3U3Q1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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