Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnnm2Q3TWN3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnnm2Q3TWN3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms