Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms