Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms