Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cpne9Q1RLL3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms