Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rpusd2Q149F1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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