Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc39dQ0VF76 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Ttc39dQ0VF76 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms