Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms