Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms