Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntnap5cQ0V8T7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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