Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnnm1Q0GA42 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms