Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnn2Q08093 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms