Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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