Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax5Q02650 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax5Q02650 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms