Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnb1Q02248 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms