Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms