Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms