Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms