Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms