Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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