Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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