Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms