Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms