Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm18289-201ENSMUST00000203356 2989 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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