Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ppfia3P60469 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ppfia3P60469 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ppfia3P60469 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ppfia3P60469 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ppfia3P60469 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ppfia3P60469 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ppfia3P60469 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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