Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdhd1P59328 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdhd1P59328 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms