Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms