Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx1P48377 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx1P48377 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx1P48377 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx1P48377 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx1P48377 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx1P48377 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx1P48377 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx1P48377 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx1P48377 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms