Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms