Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PpardP35396 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PpardP35396 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PpardP35396 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PpardP35396 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms