Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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