Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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