Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ggta1P23336 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ggta1P23336 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ggta1P23336 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ggta1P23336 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms