Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NelfeP19426 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NelfeP19426 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms