Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P18528 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18528 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms